魔法和科学是漫国两个重要的元素。也是所有文明最大的两个分类。茵蒂克丝掌管着魔法，御坂美琴掌管着科学。首次提出魔法与科学这两个概念的是魔法的禁书目录。
型月提出魔法来自远古，科学来自未来。魔法少女世界里，小樱代表魔法，奈叶代表科学。
然则魔法与科学不是仅仅以古今来作区别，魔法从一开始就存在，包括所有领域，科学是从近代开始。魔法不只是理科、工科，在一些历史悠久的国家蕴藏着丰富的人文，也归在魔法里。而从近代学科成立开始，所有领域归在科学里。
阿比盖尔威廉姆斯拥有所有领域的钥匙，并且层层分类。但她觉得自己一个人掌管钥匙太累了想让人分担一下，于是有了妖精的尾巴的钥匙魔导士，但由于竞争激烈，钥匙魔导士越来越少。
崇宫澪开始创造魔法少女，最初的魔法少女每个人都有一把钥匙，从钥匙变成法杖，每个各掌握一个领域。发展到中期时，由于自愿当正义使者的人太少，但每个人愿意为自己的愿望奋斗，就出现了丘比，和少女以实现愿望签订契约，这时的魔法少女不再以法杖作武器，而是用各种兵器，有借有还的规则，造就了悲摧的魔法少女。
到了约会大作战时期，魔法与科学已经完美地结合，于是有了星宫六喰的封解主，封印和打开魔法与科学两个最大的领域。魔法四万年与蒸汽朋克已经成为最普及的读物。